Охарактеризован нерасширенный и расширенный варианты белка атаксин-3

Охарактеризован нерасширенный и расширенный варианты белка атаксин-3

Исследователи ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН совместно с коллегами из Королевского колледжа Лондона, Института физики (Варшава) и Европейской молекулярной биологической лаборатории (Гамбург) охарактеризовали нерасширенный и расширенный варианты белка атаксин-3 посредством конформационных ансамблей, принимаемых белком в растворе, с помощью совместного использования данных ядерного магнитного резонанса, малоуглового рентеновского рассеяния и молекулярной динамики. Эти результаты помогут прояснить механизм агрегации белка атаксин-3 при развитии патологии.

Белок атаксин-3 состоит из N-концевого глобулярного домена и гибкого C-конца который содержит два или три убиквитин-взаимодействующих мотива и полиглутаминовый тракт, который, когда расширяется за пределы порога, приводит к агрегации и неправильному сворачиванию белка и вызывает нейродегенеративное заболевание атаксия типа 3. Наличие гибкого C-конца затрудняет структурное описание полноразмерного белка. Совместное использование комплементарных структурных методов позволяет получить детальную информацию о конформационной пластичности белка в нормальном и патогенном состоянии.


Рисунок 1
Рис. 1. Левая панель: схема совместного использования методов ядерного магнитного резонанса (ЯМР), малоуглового рентгеновского рассеяния (МУРР) и молекулярной динамики. Правая панель: Экспериментальные данные МУРР нерасширенного (A) и расширенного (B) варианта белка атаксин-3. На вставках показаны распределения по радиусам инерции полного (сплошные линии) и оптимизированного (пунктирные линии) конформационных ансамблей белка атаксин-3.


Подробнее в журнале Structure.