Федеральный научно-исследовательский центр «Кристаллография и фотоника» Российской академии наук создан 31 марта 2016 года на базе Института кристаллографии им. А.В. Шубникова РАН. В настоящее время в состав ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН входят три структурных подразделения: «Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова» РАН», «Центр фотохимии РАН» и «Институт фотонных технологий РАН»; а также три филиала: «Институт проблем лазерных и информационных технологий РАН», «Институт систем обработки изображений РАН» и «Лаборатория космического материаловедения ИК РАН».